单基因遗传病整体解决方案
应用背景
单基因遗传病又称为孟德尔遗传�。怯梢欢缘任换蚩刂频募膊。厦系露糯�。致病突变可能来自父母，也有可能是自身的新发突变，但都会遗传给下一代。通过基因检测可以辅助医生进行临床诊断。目前常用目标基因靶向捕获或全外显子组测序（whole exome sequencing）检测孟德尔遗传病。随着对疾病的深入研究，很多疾病有了较为明确的致病位点。针对已知致病位点设计panel，具有经济、高效和准确的优势，降低检测成本，减轻患者经济负担。
方案推荐
案例一：显性单基因遗传病诊断
有研究发现，严重的产后单基因遗传病中大约60%是显性遗传，且为新发突变。尽管这类疾病发病率相对较高，但尚未纳入产前筛查。贝勒医学院的研究人员利用单分子标签配合液相基因芯片靶向捕获技术，同时检测30个基因的新发突变和来自双亲的致病位点。
对于涉及基因数目较少的单基因遗传病筛查，理论上可以对突变热点设计引物，对多重PCR后的产物，进行高通量测序。由于引物或个体差异的原因，当引物与目标片段差异较大，可能产生漏检。对于研究比较成熟的单基因遗传病存在突变热点，但仍然要求检测必须覆盖全部外显子和剪接位点，甚至部分内含子区域，且要求超高测序深度。综合检测性能和成本，液相基因芯片靶向捕获高通量测序是目前最优方法。
显性单基因遗传病捕获芯片（30 genes panel）检测结果：
灵敏度 ??????????100% （20/20）
特异性 ??????????100%（127/127）
胎源比例准确性 ??R = 0.981(ChY)
案例一：大规模单基因遗传病筛查
为了提供更全面的单基因遗传病筛查服务，我们综合人类基因组变异数据库（Clinvar）和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）中明确致病的4000多个基因，设计涵盖5500多种单基因遗传病的单基因遗传病捕获芯片。此外还提供针对线粒体基因上的致病位点的Plus版，全方位辅助临床单基因遗传病检测。
Panel参数：
参考基因组：GRCh38/hg38（待确认）
基因数：4611
探针数量：119,880
目标区域范围：13Mb转录本区域
探针属性：SSDNA
探针长度：120nt
Panel 性能表现
捕获效率高
Panel的捕获效率和稳定性，是衡量Panel质量的重要指标，是保证检测准确性的先决条件。
从10Kb mini Panel到42Mb WES Panel，伯科液相基因芯片均展现出优异捕获效率与均一性，确保检测灵敏度。
显性单基因遗传病捕获芯片性能（30 genes panel)
高度的捕获均一性
99.4%的区域超过0.2X mean 覆盖
93.7%的区域超过 0.5X mean 覆盖
单基因遗传病捕获芯片性能（4500+ Panel）
使用Illumina Truseq Dual-Index（TC0010D）接头对NA12878构建300bp Insert预文库，分别采用1-Plex（N=4）和8-Plex（N=8）混样杂交，其中，1-Plex Input 预文库500ng, 8-Plex Input 4μg 预文库(500ng Each)，杂交16hr，随后在illumina Novaseq测序平台进行PE150模式测序。
定制灵活周期短
Panel灵活定制需求，专业探针设计，保证捕获效率和性能稳定。
七天极速定制周期，满足临床检测需求